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蛋白全序列分析——復達客戶檢測案例

2021年10月15日,客服中心反饋上海某法院有一則知識產(chǎn)權(quán)糾紛案件,涉及到蛋白質(zhì)的專利序列,需要進行蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)鑒定。蛋白質(zhì)實驗室工程師第一時間與客戶進行詳細溝通,情況如下:


客戶背景


上海某法院承擔了改革先行先試的任務(wù),按照知識產(chǎn)權(quán)專業(yè)化審判的規(guī)律,積極探索和推進改革,設(shè)立專業(yè)化審判組織、建立多元化技術(shù)事實查明制度體系、建立技術(shù)調(diào)查官制度、建立專業(yè)智庫、開展專業(yè)化司法公信力評估,以信息化促進改革、提供便民訴訟服務(wù),取得了階段性成效。在服務(wù)創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略、服務(wù)自貿(mào)區(qū)建設(shè)、服務(wù)上海建設(shè)具有全球影響力的科技創(chuàng)新中心大局中,充分發(fā)揮知識產(chǎn)權(quán)司法保護主導作用,得到了人大代表、政協(xié)委員和國際同行的普遍贊譽和充分肯定。


樣品名稱


ICA固定化頭孢菌素C酰化酶


客戶需求


客戶是上海某法院,幫助當事人雙方尋求機構(gòu)進行蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)檢測。客戶之前做過很多次測試,但是數(shù)據(jù)結(jié)果都不理想。序列覆蓋率都不能達到100%,無法判斷樣品的實際一級序列。客戶找到我們,希望出完整的方案,并進行測試。


解決方案


簽訂合同后,蛋白質(zhì)實驗室工程師第一時間對理論序列進行分析,確定了3種針對理論序列的特殊蛋白酶。基于LCMS/MS平臺分析ICA固定化頭孢菌素C酰化酶全序列。針對樣品理論序列,設(shè)計適用的多種蛋白酶,蛋白質(zhì)通過多種酶切后,裂解成多種小分子多肽片段。本項目使用NanoLC-Obitrap 質(zhì)譜儀對多肽片段進行解析,樣品被離子化后進入質(zhì)譜儀,得到一級質(zhì)譜圖后,篩選母離子進行二級質(zhì)譜圖解析肽段序列。最后根據(jù)理論序列綜合分析比對得出蛋白質(zhì)的一級氨基酸序列。


客戶反饋


客戶對數(shù)據(jù)非常認可,序列覆蓋率達到100%。


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